leidenbase包

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leidenbase : 实现一个 R 到 C/C++ 的接口,运行 Leiden 社区检测算法来找到一个基本的分区.它包括来自官方 leidenalg 发行版的所

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install_github('cole-trapnell-lab/leidenbase')devtools::install_github('cole-trapnell-lab/monocle3')安装有困难的朋友可以使用我的镜像

安装github的cole-trapnell-lab/leidenbase软件包devtools::install_github('cole-trapnell-lab/leidenbase')第五步: 安装github的cole-trapnell-

research within the Institute of Biology Leiden (IBL) aims to work on the science base of biodiversity and health, which is reflected in our

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('cole-trapnell-lab/leidenbase')devtools::install_github('cole-trapnell-lab/monocle3')没啥特别要注意的,无非是过程有点长..构建

包含在Leidenbase软件包中的Leiden community检测算法是Louvain算法的替代方案,在Monocle轨迹分析中用作默认值(见下文).

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